Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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