Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhsl1Q8CAF4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhsl1Q8CAF4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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