Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccser1Q8C0C4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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