Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms