Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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