Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hirip3Q8BLH7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hirip3Q8BLH7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms