Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca8Q8BHX3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms