Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms