Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms