Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npm2Q80W85 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms