Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf40bQ80W14 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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