Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LnpkQ7TQ95 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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