Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms