Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Vma21Q78T54 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Vma21Q78T54 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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