Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Eci3Q78JN3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms