Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnih3Q6ZWS4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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