Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms