Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms