Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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