Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tpm4Q6IRU2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tpm4Q6IRU2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tpm4Q6IRU2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tpm4Q6IRU2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms