Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Krt40Q6IFX3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt40Q6IFX3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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