Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gbf1Q6DFZ1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Gbf1Q6DFZ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gbf1Q6DFZ1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms