Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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