Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CltcQ68FD5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms