Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim24Q64127 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms