Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sin3bQ62141 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sin3bQ62141 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms