Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phox2aQ62066 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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