Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lrrn1Q61809 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Lrrn1Q61809 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lrrn1Q61809 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms