Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms