Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BcanQ61361 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BcanQ61361 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms