Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms