Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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