Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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PtprnQ60673 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms