Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prdm1Q60636 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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