Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sin3aQ60520 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms