Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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