Protein–RNA interactions for Protein: Q5S006

Lrrk2, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

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Length 2,527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrk2Q5S006 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrk2Q5S006 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrk2Q5S006 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms