Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Herc2Q4U2R1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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