Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx49Q4FZF3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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