Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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