Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms