Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm29609Q3UU56 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Gm29609Q3UU56 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm29609Q3UU56 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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