Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms