Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms