Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
YrdcQ3U5F4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
YrdcQ3U5F4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms