Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kdm4dQ3U2K5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms