Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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