Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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