Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RubcnlQ3TD16 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms