Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp2b3Q0VF55 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms